2、直肠指检：约90%的直肠癌，尤其是直肠下段癌、仅靠指检即可发现，经过直肠指检还可判断扪及肿块的大小和浸润程度，是否固定，有无肠壁外、盆腔内种植性肿块等。
3、直肠镜或乙状结肠镜检查：直肠指检后应再作直肠镜检查，在直视下协助诊断，观察肿块的形态、上下缘以及距肛门缘的距离，并采取肿块组织作病理切片检查，以确定肿块性质及其分化程度。位于直肠中、上段癌肿，手指无法触到，采用乙状结肠镜检是直肠癌的诊断方法中较好的一种。
4、钡剂灌肠、纤维结肠镜检：对直肠癌的诊断帮助不大，故不列为常规检查，仅为排除结肠直肠多发性肿瘤时应用。
5、超声显像检查。超声显像检查是在直肠内对肿瘤情况进行探查，并能够清楚的观察其浸润情况以及是否向外扩散等。这是临床上一种较新的诊断方法，能够有效的对肿瘤进行判断。
随着我国经济的发展，直肠癌检查手段越来越先进，为早期发现直肠癌提供了必要的条件和保障，使直肠癌的确定成为可能。关于直肠癌的确定，在医院的选择上也要有一定的针对性，可以选在这方面疾病比较有经验的医院，这样才能做到事半功倍。
总的来说，早期直肠癌难以发现，而个体差异又异常复杂，在直肠部位，都可能发生致命的癌变。所以，关于直肠癌的确定不可能通过一种检查方法或一种仪器设备(如全身PET-CT检查)就能得出正确结果，要综合起来，才能确诊。
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