所谓的巧克力囊肿，就是指子宫内膜异位瘤，是发生于卵巢内的子宫内膜异位症，随着每月的月经来潮，这些异位的内膜组织也会产生月经造成经血堆积于卵巢内，形成卵巢肿瘤，因内容物极像巧克力之状，故通称巧克力囊肿。
如果病情较轻的，且还没有影响到受孕能力的巧克力囊肿的患者，怀孕可能是最好的治疗方法。因为在怀孕期间，卵巢上的子宫内膜会渐渐萎缩，然后被吸收甚至消失。从而有效预防了巧克力囊肿的进一步形成。 如果已经发生了不孕的情况，在治好病后，仍然可以正常的怀孕。 所以，得了巧克力囊肿会引起不孕，而怀孕则能预防巧克力囊肿。
如囊肿较严重，伴有炎症、粘连、囊肿较大、影响受孕等情况则应先治疗，后怀孕。对胎儿一般不会有影响。
