病因可能是器质性病变或是功能失常。许多全身性疾病如血液病、高血压病、肝病、内分泌病、流产、宫外孕等均可引起月经失调。
经常打乱生物钟熬夜的女性出现月经不调的几率是作息规律者的2倍，其痛经、情绪波动的情况也很多，女性长期熬夜或者
失眠会改变身体原有的生物钟，从而引发机体生命节律发生紊乱。
这种紊乱将导致一系列内分泌功能的失调，进而影响女性的排卵周期。一旦排卵周期被打乱，就可能出现月经不规律，随之会使孕激素分泌不平衡。而一些女性高发肿瘤，都与雌、孕激素的分泌异常有着密切关系。
