科室设置医院科室设置齐全，其中包括：
临床科室19个：急诊科、内科、外科、妇科、儿科、针灸科、骨伤科、肛肠科、皮肤科、眼科、耳鼻喉科、推拿科、感染性疾病科、重症医学科、康复科、治未病科、麻醉科、体检科、口腔科。
医技科室8个：药学部、医学检验科、医学影像科、手术室、病理科、输血科、营养科、功能检查科。
3技术优势骨伤科现有六个病区，在番禺区骨伤科病人收治量最大，是目前广州南部地区最具影响力的骨伤科。骨伤科能开展四肢、脊柱等各种骨折的内固定术，肩、髋、膝、指关节人工关节置换术，脊柱侧弯矫正术，腰椎及颈椎各种开放性手术，其传统的中医骨伤诊疗方法如骨折手法复位、小夹板固定等也疗效独到。
脑病科大量运用中药、中成药，配合针灸、理疗、按摩推拿等中医康复手法，以治疗脑血管疾病为主，并开展多种脑病科疾病如眩晕、头痛、郁证等治疗。
针灸科除了对普通常见病、多发病有显著疗效外，对亚健康状态、急慢性损伤以及小儿脑瘫等疾病有非常独到的疗效，深受患者信任。
眼科在当地及周边地区也有较大的影响，白内障超声乳化术的手术量仅次于中山大学眼科医院，在广州地区中医院名列前茅。
治未病科采用中医四诊结合现代医学诊疗手段，对亚健康人群进行体质分型，并针对各类常见病，慢性病，疑难杂病提出个体化体质调养方案，采用中药，腹针，艾灸，气功，音乐，心理调摄等多种方法相结合，最大程度减轻患者的痛苦，取得了患者的一致好评。并多次通过电台，电视台，番禺日报等公共媒体进行各类健康讲座，提高大众的健商。
4院内设备医院医疗设备总值1亿多元，拥有菲利浦六排螺旋CT机、美国膺视酷眼准分子激光系统、西门子直接数字化成像系统(DR机)、史塞克1288HD全高清手术腹腔镜系统、德国西门子移动式C型臂X线机、东芝SSA-790A彩色超声诊断仪、日本奥林巴斯CV-260SL电子胃肠镜系统、日本日立7180(ISE)型全自动生化分析仪、瑞士哈美顿全自动酶免分析系统、德国蔡司外科手术显微镜、高配置的救护车3台;西门子1.5T磁共振成像系统已完成招标工作，准备安装。
5获得荣誉2012年通过国家三级甲等中医医院评审，成为三级甲等中医医院;2000年获广州市“九.五”杏林工程重点中医急诊科建设达标单位;医院被评为全国中医治未病试点单位;骨伤科被评为广州市“1357”工程重点中医专科(专病)、 广东省中医特色专科、国家中医药管理局第二批农村医疗机构中医特色专科;脑病科被评为广东省中医特色专科;针灸科被评为广州市名科单位;护理部被评为中华中医药学会“第二届全国中医护理先进集体”。获科研成果多项，多年来获省、市、区先进单位和广东省文明中医院称号。曾获2009年度无偿献血先进集体奖、2006-2009年度广州市价格诚信单位称号、番禺区卫生局“广州亚运会亚残运会番禺赛区医疗卫生保障先进单位”称号。2010年，被评为番禺区2010年度“双百共建文明社区”活动先进单位、2010年度番禺区创建全国文明城市工作先进单位。2011年，获2011年无偿献血促进奖。
